Как важный либеральный шаг в деятельности Петра 3 историки оценивают ликвидацию Тайной канцелярии, действовавшей ещё со времён правления Петра 1.  К положительным сторонам его политики можно отнести также веротерпимость. Пётр 3 прекратил преследования старообрядцев и планировал реформировать Русскую православную церковь по протестантским канонам.  

Однако на  деле  внутренняя  политика  императора вызывала массу недовольства у общественности. Пётр 3  пренебрежительно относился  к духовенству, оскорблял своими указами Синод,  закрывал  домашние  церкви, чем  вызвал  возмущение  народных   масс.

В армии   император   стремился   последовательно   внедрять   прусские   порядки,  что  не прибавило ему популярности в  рядах гвардейцев  и настроило против него дворянство.