Особую ботаническую ценность имеет шихан Тра-Тау, так как он относительно более сохранен от разработок. Флора этого объекта содержит, кроме того, наибольшее количество редких видов. Растительность коренных склонов «купола» отличается мозаичностью, а растительность пологих склонов «пьедестала» сравнительным однообразием. Это объясняется тем, что на пологих делювиальных склонах почвенный субстрат довольно однообразен,  а также нивилирующее воздействие на растительность оказала пастьба скота.Дерновинно-злаковая  степь.  Распространена  на  Тра-Тау  небольшими фрагментами на выпуклых частях склонов. В покрове преобладает типчак, мятлик   узколистный,    изредка   ковыль   перистый. Отсутствие ковыля в числе доминатов объясняется воздействием пастьбы скота.

Типчаковая степь. Занимает почти весь делювиальный склон и рассматривается как явление вторичное, обусловленное пастьбой скота. Кроме типчака здесь есть и представители разнотравья, но они очень угнетены и обречены на полное вырождение. Среди разнотравия, как и на всяком пастбище, есть пастищевыносливые виды (подорожник средний, клевер ползучий), сорные и непоедаемые (ноннея темная, тысячелистник обыкновенный) и формационные реликты (шалфей степной, душица обыкновенная, зопник клубненосный). По формационным реликтам можно судить, что прежде здесь была злаково-разнотравная степь.

Разнотравно-дерновинно-злаковая степь располагается на севере в нижней части делювиального склона, где распространены карстовые воронки; на северо-востоке коренного склона.

Разнотравные степи расположены узкой полосой в нижней части юго -восточного склона вдоль опушки леса. Доминантами первого яруса являются шалфей степной, мытник крупноцветковый, клевер горный. В состав травостоя входят также лапчатка серебристая, короставник полевой, адонис весенний, лабазник шестилепестный, коровяк ветвистый и эспарцет сибирский.

Каменистые россыпи находятся на разных стадиях закрепления растительностью. Чаще всего на них отсутствуют сложные фитоценозы, характерна мозаичность - растения размещаются одновидовыми пятнами. Растения на россыпях гипертрофированы. Высота их и размер листовых пластинок раза в три выше нормы. Для каменистых россыпей обычно крупнотравье - вайда ребристая, чистотел большой, валериана лекарственная, василек русский, вязель разноцветный, луки. Северный склон Тра-Тау пологий, южный - крутой. Он загроможден крупными глыбами, которые образовались при взрывных работах. Характер рельефа склонов и их экспозиция обусловили различие в растительном покрове. Преобладает разнотравье: душица, коровяк, вероника колосистая, зопник клубненосный, бедренец камнеломковый, лапчатка серебристая, подмаренник, девясил британский, гвоздика травянка, хотьма тюрингийская, чернокорень, пустырник. Из бобовых: вязель, люцерна серповидная. К разнотравью примешиваются злаки: типчак, тонконог, костер, но их роль в травостое незначительна. Выделяются степные кустарники: дикий миндаль (бобовник) и спирея. Растительность Тра-Тау и ее окрестностей однотипна. Сходство экологических условий подножий и склонов благоприятствует миграции и взаимному обогащению флоры. У подножья склона северной экспозиции много карстовых воронок. Они достигают глубины 6-7 метров при диаметре 15-20 метров, находится чаще всего на расстоянии двух - трех метров друг от друга. В дальнейшем возможно их слияние и образование слепых логов. Воронки имеют ассиметричное строение. Склоны северной экспозиции, примыкающие к подножью, крутые и часто обнаженные, а склоны южной экспозиции пологие.

-