Основоположник теории Томас Гент Морган, американский генетик, нобелевский лауреат, выдвинул гипотезу об ограничении законов Менделя.

В экспериментах он использовал плодовую мушку-дрозо-филу, обладающую важными для генетических экспериментов качествами: неприхотливостью, плодовитостью, небольшим количеством хромосом (четыре пары), множеством четко выраженных альтернативных признаков.

Морган и его ученики установили следующее:

1. Признаки и свойства организма определяются генами. Гены локализованы в хромосомах и расположены там линейно на определенном расстоянии друг от друга.

2. Гены, расположенные в одной хромосоме, наследуются совместно или сцеплено, образуюя группы сцепления. Число групп сцепления равно гаплоидному набору хромосом: 4- у мушки – дрозофилы , 23 -  у человека.

3. Между гомологичными хромосомами может происходить обмен участками (кроссинговер) во время мейоза; в результате кроссин-говера возникают гаметы, хромосомы которых содержат новые комбинации генов.

4. По частоте кроссинговера можно судить о расстоянии и порядке расположения генов в хромосоме.  Чем   расстояние больше, тем выше частота кроссинговера. За единицу расстояния между генами принимают 1 морганиду (1% кроссинговера) или процент появления кроссоверных особей. При значении этой величины в 10 морганид можно утверждать, что частота перекреста хромосом в точках расположения данных генов равна 10% и что в 10% потомства будут выявлены новые генетические комбинации.

5. Для выяснения характера расположения генов в хромосомах и определения частоты кроссинговера между ними строят генетические карты. Карта отражает порядок расположения генов в хромосоме и расстояние между генами одной хромосомы.  

 6. Набор хромосом в клетках данного типа (кариотип) является характерной особенностью вида.